Redatelj, scenarist i producent. Studirao je medicinu, no prava ljubav mu je bila film. Sedamdesetih godina prošloga stoljeća bio je asistent mnogim slavnim redateljima (René Clémenta, Claude Berri i Claude Zidi). Redateljski debut ostvario je kratkometražnim
Le chien de Monsieur Michel (1977). Prvi cjelovečernji film režirao je četiri godine kasnije pod imenom
Diva (1981). Film domaća kritika nije podržala, no postigao je međunarodni uspjeh i naposlijetku je Beineix dobio Césara za najbolji prvi film 1982. godine.
Mjesec u slivniku (La lune dans le caniveau, 1983) kritika je dočekala još lošije i film je doživio komercijalni neuspjeh. Kako bi očuvao kreativnu slobodu 1984. je osnovao vlastitu producentsku kuću
Cargo Films i unutar nje režirao
37°2 le matin (1986), međunarodno veoma poznat i nagrađivan pod imenom
Betty Blue. Slijedeći filmovi
Rosalyne i lavovi (Roselyne et les lions, 1989) i
IP5: L'île aux pachydermes (1992) u kojem je zadnju ulogu ostvario Yves Montand, prošli su nezapaženo. Beineix je potom režirao dokumentarne filmove socijalne tematike
Les enfants de Roumanie (1992),
Otaku (1994) i
Assigné à résidence (1997), da bi se igranom filmu vratio 2001. godine trilerom
Mortel transfert. Uslijedio je dokumentarni televizijski film
Loft Paradoxe (2002).